Rita Lee conta neste volume como o ratinho Alex combate os malvados que querem acabar com a Amazônia, os bichos e os índios, por meio de queimadas e derrubando as árvores da floresta. Em Dr. Alex na Amazônia, o ratinho fica amigo de uma tribo indígena que estava muito preocupada com todas as maldades que vinham fazendo na mata.

A autora que desde sempre lutou pela causa animal e ambiental lançou a série entre 1986 e 1992. Este volume conta com texto revisitado pela autora, novo projeto gráfico e ilustrações de Quihoma Isaac. Outros três volumes completam a coleção: Dr. Alex, Dr. Alex e os Reis de Angra e Dr. Alex e o Phantom.